Văn phòng điện tử
| Phòng Kế toán Tài vụ |
| Phòng Tổ chức Hành chính |
| Phòng Kế hoạch Đầu tư |
| Phòng Kỹ thuật - Môi trường |
| Xí nghiệp Quản lý Bãi & Xử lý chất thải | |
| Xí nghiệp Kinh doanh dịch vụ và Xử lý môi trường | |
| Xí nghiệp Vận chuyển |
| Chi nhánh Đội Môi trường Hòa Cường | |
| Chi nhánh Đội Môi trường Thanh Khê | |
| Chi nhánh Đội Môi trường Hải Châu | |
| Chi nhánh Đội Môi trường Sơn Trà | |
| Chi nhánh Đội Môi trường Cẩm Lệ | |
| Chi nhánh Đội Môi trường Ngũ Hành Sơn | |
| Chi nhánh Đội Môi trường Hòa Vang | |
| Chi nhánh Đội Môi trường Sông Biển |